Ginkgo Bioworks：ビル・ゲイツが支援した合成生物学のユニコーン、SPACバブルから極限のサバイバルへ

創業のきっかけ

2008年、MITのコンピュータ科学教授Tom Knightが「生物の標準化設計」という理念を提唱し、生物プログラミングはコンピュータプログラムのようにモジュール化されるべきだと考えた。彼はMITの合成生物学研究室内で、4人の学生（Jason Kelly、Reshma Shetty、Barry Canton、Austin Che）と共にGinkgo Bioworksを設立した。Knight教授は以前、MITコンピュータシステム研究所の中心メンバーとしてARPANETの初期設計に関与しており、50歳で生物学に転向し、細胞をコンピュータチップのように「プログラミング」できるという合成生物学の基礎理念を打ち立てた。5人はバラの香りの遺伝子を酵母に注入する実験を最初の商業的検証とし、酵母に自律的にバラの香料を生成させることで、高価な天然抽出物に代わる「微生物による工業ファウンドリ」モデルの原型を実証した。Ginkgoは「生物プログラミング企業（The Organism Company）」と位置づけ、農業、食品、消費財企業が微生物株を設計するのを支援し、顧客の初期研究開発コストの重複を削減している。

成長のマイルストーン

転換点

• 2008年、MIT教授Tom Knightが4人の大学院生とGinkgoを設立し、バラ香料酵母プロジェクトで微生物ファウンドリモデルを学術から商業へ転換させた。
• 2016年、ボストンに世界初の自動化バイオファウンドリを建設し、手作業の研究室からロボットによる並行遺伝子編集プラットフォーム企業へと進化し、ユニコーン級へ躍進。
• 2021年9月、SPACを通じて評価額150億ドルで上場。史上最大規模のSPAC案件となったが、売上の85倍という評価額はバブルの兆候であった。
• 2023年、Biosecurityのパンデミック特需が消滅し、Cell Engineering事業では売上の穴を埋められず、株価が1ドル以下に下落し、中核ビジネスモデルの成長の遅さが露呈。
• 2025年、分子診断子会社Concentricを中核事業から分離し、Cell Engineering事業に回帰。2026年末のEBITDA黒字化を目標とする最後の自救策を講じた。

失敗とつまずき

• 2023年、COVID検査契約終了によりBiosecurity部門の四半期売上が1億ドルから数百万ドルへ急落し、株価が1ドル以下に下落して上場廃止の危機に直面。
• 2024年、従業員の35%（約400人）の削減を余儀なくされ、CEOが売上減少と損失拡大の二重苦を認める事態に。
• 2024年10月、1:40の株式併合を実施するも、資本市場の信頼は回復せず再融資が困難な状況が続く。
• 2026年第2四半期の売上が2,020万ドルと市場予想を大きく下回り、EBITDA黒字化目標の達成が困難な状況に陥り、資本枯渇の圧力が高まっている。

主要データ

• 借入上場時の評価額：150億ドル（2021年9月）（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 2019年プライベートエクイティ評価額：42億ドル（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 2022年通期売上高：約4億9,000万ドル（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 2025年通期売上高ガイダンス：1億6,700万〜1億8,700万ドル（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 2025年細胞工学事業売上高：1億1,700万〜1億3,700万ドル（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 2025年バイオセキュリティ事業売上高：3,700万ドル（通期）（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 2026年第2四半期売上高：2,020万ドル（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 2026年第2四半期純損失：5,730万ドル（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 2024年人員削減数：約400人（全従業員の35%）（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）
• 上場後・削減前の従業員数：1,218人（会社開示、2026年時点、第三者による再検証なし）

競合・同業

Ginkgo Bioworksの合成生物学プラットフォーム分野における主な競合には、ZymergenやAmyrisがあり、いずれもSPACやIPO後に評価額が暴落した合成生物学企業である。Zymergenはバイオファウンドリプラットフォーム事業における最も直接的な競合であり、同様にロボット自動化ラボ路線を歩んだが、2021年の上場後に主力製品BioHADEの失敗で評価額が暴落し、2022年にGinkgoが一部資産を合併吸収した。Amyrisはパーソナルケアや消費財分野の合成生物学原料に注力していたが、2023年に債務問題で破産保護を申請し、主要な菌株資産が分割売却された。遺伝子編集ツール分野では、SynthegoやTwist Bioscienceがより垂直的なCRISPR試薬やDNA合成サービスで参入し、Ginkgoのプラットフォーム型受託モデルと差別化している。農業分野では、GinkgoとBayerの合弁会社が微生物設計による農業用生物製剤を開発しているが、CortevaやSyngentaといった伝統的な農薬大手の社内研究開発と競合している。総じて、合成生物学プラットフォーム企業の商業化検証サイクルは極めて長く、多くの同業他社が2021〜2023年にSPAC上場後の評価額崩壊と再編を経験した。Ginkgoが2026年末までにEBITDA黒字化を実現できるかが、業界における合成生物学プラットフォームモデルの実現可能性を占う重要な試金石となっている。